Si no recuerdo era así.
En Junio te presentas a las dos (común y específica), pero solo haz la parte común y entregando la parte especifica en blanco. Aprobarías la común y te quedaría pendiente la especifica.
En septiembre con la común aprobada, vas a convalidad la específica ya que tendrías el título.
Desde luego yo también tuve problemas con esto, esta muy mal hecho.