Hola Laura
en mi empresa trabajamos con un software llamado Wingest de http://www.sfy.com que tienes gestión de compras y almacenes. Nos esta dando muy buen resultado, y llevamos un par de años trabajando. El programa no es solo de compras, es integrado, es decir que tiene compras, ventas, stocks y otras opciones.
Espero que la información te sirva.
Joan